2016年  
　　1月
　　详见第21话
　　下旬，冬月在地下都市西区第8区失去消息，其被抓去SEELE审问，冬月被加持救回，下午，加持被枪杀身亡。美理受到侦讯。

　　2月
　　详情见第22话
　　上旬，第15使徒来袭，并向贰号机进行心理攻击，明日香崩溃，完全失去战斗意志，贰号机沉默。零号机以朗基奴斯长枪消灭目标。

　　详情见第23话
　　中旬，第16使徒来袭，零号机自爆与使徒同归于尽。三人目零登场。
　　几天后，美理解开胶囊，决心继承加持的心意，追查补完真相。
　　因被源堂出卖，律子破坏DUMMY System。

　　详情见第24话
　　下旬，明日香失踪，七日后，被谍报部2课寻回。第五适格者渚薰抵达NERV。

　　3月

　　剧场版25话、26话AIR．真心为你。

　　上旬，某日上午5时59分，美理终于知道第2次冲击的秘密。
　　律子对MAGI加上666号防壁，SEELE下令直接强行占据NERV本部设施。上午6时正，5国支部MAGI同时入侵NERV本部，目标在夺取MAGI主系统。
　　同日，SEELE颁报A-801训令，取消NERV本部所有特权。 战自大队入侵，源堂宣报全员进入第1战斗态势。
　　第三新东京市遭到N^2爆雷疯狂轰炸，连同天顶都市消失。
　　7时23分23秒，于46通道发现真嗣。美理出发救援。 明日香被运往贰号机，发射上70米深的湖底。 成功救回真嗣，并带真嗣往初号机而去。

　　明日香觉醒，向战自发动反击。 美理在第6紧急电梯入口被枪击受伤。 美理对真治献出最后一吻，之后真治乘电梯到第7收容处。
　　约2分钟后，律子意图执行自爆系统，但失败。
　　2分钟后，贰号机大战EVA量产机。
　　美理被炸死，享年29岁。
　　律子被源堂枪杀身亡，享年31岁。 源堂意图令ADAM与LILITH融合。
　　贰号机击败EVA量产机，电源用尽， EVA量产机再起动，并将贰号机肢解。
　　初号机自行启动，真嗣乘坐其中。朗基奴斯之枪从大气层飞回初号机前。“仪式”开始进行。
　　EVA量产机在初号机身上刻上圣痕，与初号机形成了Tree of Sephirot。
　　S^2机关解放，释放高能量爆炸，战自大队全灭。
　　地下都市回归真实面貌，LILITH之卵，黑之月出现。
　　第18使徒出现。零背叛源堂，自行和LILITH融合，源堂失去右手。
　　EVA量产机与零同化。真嗣心理图混乱。初号机与朗基奴斯之枪同化，形成生命之树。反AT力场增大，生物已无法保持形态。补完计划最后阶段。灵魂之屋开启，全人类形体化成LCL。真嗣放弃补完计划，走出第18使徒。

　　最后，地球出现生命之海。真嗣和明日香存活于世。

作者：十三@::十三|ShineKid::
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